要搭建一个医疗器械B2B网站，您需要考虑以下几个方面：

1. 确定目标受众：首先，明确您的网站将服务于哪些用户群体，如医院、诊所、药店或其他医疗设备供应商。

2. 网站功能：确定网站的主要功能，如产品展示、在线订购、价格查询、库存信息、售后服务等。

3. 设计风格：根据目标受众的需求和喜好，选择合适的颜色、布局和设计风格，使网站看起来专业且易于使用。

4. 技术支持：选择合适的网站建设平台，如WordPress、Shopify等，或寻找专业的网站开发团队为您定制开发。

5. 产品分类：对医疗器械进行合理分类，便于用户查找和浏览。可以按照设备类型、品牌、用途等进行分类。

6. 产品信息：提供详细的产品信息，包括产品图片、描述、规格、使用方法、注意事项等。

7. 在线支付：与支付平台合作，为用户提供安全便捷的在线支付方式，如支付宝、微信支付、PayPal等。

8. 物流配送：与可靠的物流公司合作，为用户提供快速准确的配送服务，并提供物流查询功能。

设置医疗器械B2B网站的在线支付系统需要遵循以下步骤：

1. 选择支付渠道：首先，选择一种或多种可靠的在线支付渠道，如支付宝、微信支付、PayPal、银联在线支付等。您可以根据目标市场的用户习惯和需求来选择合适的支付渠道。

2. 注册支付账户：在选择好支付渠道后，需要注册一个商户账户。通常，您需要提供一些公司信息、银行账户信息等，以便进行身份验证和资金结算。

3. 配置支付参数：在支付渠道的后台管理系统中，您需要配置一些支付参数，如商户ID、密钥、回调地址等。这些参数是用于验证交易信息和确保支付安全的关键信息。

4. 集成支付接口：在您的网站上，需要集成对应支付渠道的支付接口。这通常需要编写一些编程代码，以实现用户下单、支付、回调等功能。您可以参考支付渠道提供的API文档来进行开发。

5. 测试支付功能：在正式上线前，应对支付功能进行测试，确保支付过程顺畅无误。您可以使用支付渠道提供的沙箱环境进行测试。

确保医疗器械B2B网站的支付安全非常重要，以下是一些建议：

1. 使用可靠的支付渠道：选择知名且信誉良好的支付渠道，如支付宝、微信支付、PayPal等，它们已经建立了完善的安全机制。

2. 配置安全参数：在支付渠道后台管理系统中，正确配置支付参数，如商户ID、密钥、回调地址等，并确保这些信息不被泄露。

3. 使用HTTPS协议：为网站启用SSL证书，使用HTTPS协议来加密数据传输，防止数据在传输过程中被窃取或篡改。

4. 防止SQL注入：在网站后台数据库操作时，采用预编译语句或参数化查询来防止SQL注入攻击，确保用户数据安全。

5. 限制访问权限：限制网站后台管理员的访问权限，确保只有授权人员才能进行关键操作，如修改支付设置、查看用户信息等。